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基因组重测序
低深度重测序
低深度重测序
简要概述
全什么是人类什么是基因基因遗传规律组低厚度重测序（Low coverage WGS，LcWGS）指的是凭借较低厚度（~1×）的重测序资料对其进行隐性人类什么是基因基因遗传规律进化人类什么是基因基因遗传规律分型，在这之后经由什么是人类什么是基因基因遗传规律型填色，将低孔隙率资料填色为高孔隙率什么是人类什么是基因基因遗传规律型资料。LcWGS 不要控制系统开拓，测序的低成本投入，还可以获得全什么是人类什么是基因基因遗传规律组隐性人类什么是基因基因遗传规律进化，更有要能帮助于大范围子样本的相对性状手机定位及 GS 生物育种利用。
应用场景
01. 性状定位
动植物全基因组关联分析
02. 遗传评估
动植物全基因组选择育种
技术优势
  • 变异信息
    丰富
    可换取全隐性基因基因组的隐性基因变种
  • 高性价比
    以太低的测序资金低，获取高体积的标记符号，检查转化率高
  • 大群体
    样本检测
    支持于大消费者的表观遗传型检查测量及研究分析
  • 分型
    准确性高
    依托于填色算法为基础，临床诊断精确率电动车续航98%
技术流程
优秀案例
低深度重测序--猪胴体分割性状及形态性状的遗传解析与基因组预测
本研究测定了长白、大白、长大二元以及杜长大三元猪4个群体的2,012头猪的17个分割肉性状和14个胴体性状。使用单倍型GWAS分析和基于基因型填充数据的GWAS分析分别鉴定到14个和112个与胴体分割性状极显著相关的QTLs。利用“中芯一号”芯片检测数据和基因型填充数据对这四个不同群体的分割肉性状和胴体性状进行全基因组选择研究。比较不同基因型数据、不同群体、以及不同预测模型对基因组预测准确性的影响。
图1 GWAS物理性质导航定位及GS结局十分
参考文献
Xie, L., Qin, J., Rao, L., Cui, D., Tang, X., Chen, L., Xiao, S., Zhang, Z., & Huang, L. (2023). Genetic dissection and genomic prediction for pork cuts and carcass morphology traits in pig. Journal of animal science and biotechnology, 14(1), 116.
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