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全基因组关联分析(GWAS 分析)
全基因组关联分析(GWAS 分析)
简要概述
全表观遗传表观遗传组组绑定剖析(Genome-wide association study,GWAS)是属于在全表观遗传表观遗传组组面积内去寻找与相应物理性质或常见疾病有关的遗传表观遗传表观遗传遗传变异的剖析做法,可立即判定出与表型表观遗传遗传变异明显有关且还具有相应功能模块的表观遗传表观遗传组位点或标示位点,是非常重要物理性质调整表观遗传表观遗传组发现探析的常见来解决情况报告。
应用场景
01. 复杂性状解析
广泛应用于揭示复杂农艺性状的遗传基础,协助研究者深入理解性状形成机理。
02. 分子育种
辅助分子标记辅助选择和基因组选择,使育种过程更加高效和精确。
03. 疾病抗性研究
GWAS对于发现与植物病害抗性相关的基因至关重要。

技术优势
  • 无需构建专门遗传群体
    不能自己特地建设遗传性分离处理客户群体,简化法了理论研究标准流程,合理安排了時间和产品。
  • 多性状定位能力
    可同時够满足多物理性质定位系统的诉求,面对冗杂物理性质的分析一下具有效主要优势。
  • 高分辨率关联分析
    不错确定比较高的分数辨率的关连进行分析,或是能进行关连到基因组。
  • 多种关联分析模型
    会抉择探索要求抉择最应该的仿真模型采取解析,若想提供了会更加性情化的解析效果。
技术流程
优秀案例
花生(Arachis hypogaea L.)是一种重要的食用油和食用性豆类作物。该研究报道了390份花生种质的全基因组变异图谱,表明花生可能是分别传入中国南方和北方,形成两个栽培中心。选择信号分析强调了花生改良过程中两个亚基因组之间的不对称选择。一个来自中国南方的经典家系为研究人工选择对花生基因组的影响提供了背景。
GWAS分析确定了22 309个与28个农艺性状的显著关联的位点,包括植物结构和油生物合成的候选基因。该研究揭示了中国花生的迁移和多样性,并为花生改良提供了有价值的基因组资源。
参考文献
Lu Q, Huang L, Liu H, et al. A genomic variation map provides insights into peanut diversity in China and associations with 28 agronomic traits. Nat Genet. 2024;56(3):530-540. doi:10.1038/s41588-024-01660-7
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